西暦２０３６年。東京は原発事故による放射能汚染で封鎖されていた。そんな死都・東京に３人の女子高生が送り込まれる。彼女たちの名は［コッペリオン］。遺伝子操作によって生まれつき放射能の抗体を持つ、陸上自衛隊・第三師団所属の特殊部隊である。